داستان فیلم درباره‌ی دو برادر به‌ نام‌های ادوارد و آلفونسو الریک است که پس از مردن مادرشان، قصد دارند به‌ کمک دست نوشته‌های پدر خود از علم کیمیاگری استفاده کرده و وی را زنده کنند. اما اتفاقات مطابق میل این دو برادر پیش‌ نرفته و حال ماجراجویی بزرگتری در انتظار ادوارد و آلفونسو است و…